三国阵营系统是SS9赛季的新玩法，玩家得选择魏蜀吴的阵营上场。并在战斗中累积军功、提升官职，拿到丰厚的俸禄奖赏。再通过奖励换取自己想要的军需、神兵，实现秋梨村的霸业。注意己方的俸禄初始是比较低的，需要不断提交特定战利品升官。升的越高就能领到越高的俸禄，且俸禄最多能保存一天。至于赛季和永久角色只会发放一份俸禄，会以它们达到的最高官职为发放标准。比如说我方加入了吴阵营，升为横江将军时的俸禄为500点贡献。升为荡寇将军的情况下，将得到600点。除了以上规则外，三国阵营还有特殊的宠物喵、神兵。
宠物喵包括刘备喵、曹操喵、孙权喵等，其中刘备喵的被动技名为昭烈号令。昭烈号令间隔一段时间，会提升附近队友的自然伤。曹操喵的被动buff是魏武号令，间隔一段时间能增加附近友方的物伤。孙权喵的被动技名为仲谋号令，能隔一会儿就让附近友方的元素伤提升。至于神兵需要官职达到一定阶段才可以获取，像蜀国的有青龙偃月刀、丈八点钢矛等。青龙偃月刀能提升对勇士和boss怪的总伤，出伤的同时将恢复自身血量。丈八点钢矛可增加对精英怪和小怪的伤害，打败它们的情况下还能增伤。魏国的神兵包括倚天剑、双铁戟，前者可让黄天祭坛内的魔物吃到更多易伤。
若处于黄天祭坛的玩法中，那我方则能获得减伤。后者双铁戟能在灾厄之心，或者潘多拉迷城的活动中增伤。处在灾厄之心的高压玩法里面，还会得到减伤buff。吴国的神兵有古锭刀、传国玺，古锭刀可让玩家在试炼之地的总伤提升。进入试炼之地后，间隔一段时间会拥有移速、减伤的buff。传国玺能提升黄天祭坛的军需产出，且能重置祭坛的挑战喧响。除了以上6种，还有1种神兵是无专属阵营的方天画戟。方天画戟也具备增伤效果，对面只有一个怪时会打出更多总伤。注意在三国阵营系统里面，玩家达到一定的官职之后是可以转阵营的。且魏蜀吴不同体系的官职相互独立，每个都可以升满。
另外在活动中有一个专门的名词，那就是黄天祭坛。该祭坛有小、中、大以及特殊型，其中小型的黄天祭坛挑战波次有限，每完成一轮都可以结算离开或者继续往下。把所有的轮次完成就能带走全部奖赏，但中途被击败会失败且无法复活。中型的挑战波次比小型更多，且完成一轮后得自选诅咒debuff。这些诅咒将提升战斗的难度，重复选已获得的诅咒才会让负面升级。大型的黄天祭坛比较稀有，得用调查报告才可以开启。它的规则和中型的相似，同样要选诅咒debuff。只不过它的挑战轮次更多且新增了boss挑战，奖品也更为丰厚。至于特殊的黄天祭坛是奖励性质的，里面的魔物能持续刷新。我方打败的魔物波次越多，最终得到的物资就会越高端。