游戏中“海平面上升”的灾害和气候变化，以及二氧化碳的浓度挂钩。气候变化又可以分成七个阶段，阶段一的变化点数为0/2。此时期的海平面会升高0.5米，且极地冰盖会化掉10%。阶段二的变化点数将会变成0/3，此时升高的米数会从原本的0.5米变成1.0米。若是有低于此高度的低地格子，那它将会被洪水淹没。且海岸低地会变为1米，冰盖融化程度会从10%变成20%。阶段三的点数是0/5，此刻海平面将上升到1.5米、低地则是2米。处于或低于此高度的地块也会被淹没，融化幅度将变为30%。
阶段四和五的气候变化点数分别是0/5以及0/6，它们海面上升程度是2米和2.5米。极地冰盖则会融化40%和55%，此刻风暴、洪水将不再给地皮提供肥沃度。且风暴和干旱这类的灾害在经过土地后，有较低的概率移除格子之前的肥沃度。阶段六和七的时候，点数会变为0/7和0/8。此时期的海面会分别升高3米和3.5米，冰盖融化幅度则是70%和85%。这两阶段中，低于一定高度的格子将会沉入海底。
注意在海平面上升后，被洪水淹没和沉入海底的格子有所不同。被淹没的格子尚可挽救，可通过拦洪坝这类的建筑来进行保护。但如果是沉入海底的话，那变为水域的格子是没有办法复原的。在受到以上灾害影响的时候，区域里面的改良设置会被摧毁、人口将会下降。且随着二氧化碳的升高，地图之中出现干旱、江河泛滥、风暴的概率也会升高。等气候变化达到最高峰值之后，场景中奖出现荒漠化的情况。我方若是想在海平面上升的灾害里面，防止低地被侵袭的话。
需在后期的科技里面，将防洪坝这类的市中心建筑解锁。防洪坝在初次修建的时候，仅仅會消耗80的生産力。但如果城市中已經有很多的低地被淹沒，那則得消耗800的生産力。至于“幹旱”的災害和前面的海平面上升恰恰相反，它是水量少引起的。其一般出現在遠離河流、海岸的平原、草原，或者缺乏樹木丘陵的地皮上。會朝著其他的單元格蔓延，並隨著全球變暖而提升强度等级。干旱会削减1点的食物产出，并掠夺种植园、内陆牧场、棚屋还有营地的改良设施。想要缓解此类灾害，玩家需要多建造堤坝、水渠、梯井或者浴场等设施。